Ngoài ra, Ban Chỉ đạo có 3 Phó Trưởng ban, gồm: Thứ trưởng Nguyễn Danh Huy - Phó Trưởng ban thường trực; Thứ trưởng Nguyễn Văn Sinh và Thứ trưởng Phạm Minh Hà. Cùng các thành viên là đại diện các Vụ, Cục trực thuộc Bộ Xây dựng; ông Đặng Sỹ Mạnh, Chủ tịch Hội đồng thành viên Tổng công ty Đường sắt Việt Nam; và các Giám đốc Ban Quản lý dự án được giao quản lý.
Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ chỉ đạo nghiên cứu, thực hiện các phương hướng, nhiệm vụ, giải pháp giải quyết những vấn đề liên quan đến Dự án đầu tư xây dựng các tuyến đường sắt kết nối Trung Quốc (Lào Cai - Hà Nội - Hải Phòng, Hà Nội – Đồng Đăng, Hải Phòng - Hạ Long - Móng Cái) của Bộ Xây dựng (sau đây gọi tắt là các Dự án) nhằm bảo đảm tiến độ, chất lượng.
Ban Chỉ đạo cũng chỉ đạo Chủ đầu tư/Ban Quản lý dự án, các cơ quan, đơn vị liên quan thực hiện các công việc: Tổ chức thực hiện dự án theo chức năng, nhiệm vụ được giao; phối hợp chặt chẽ, có hiệu quả trong tham mưu, đề xuất các giải pháp, biện pháp thực hiện các dự án; Kiểm tra, đôn đốc các tổ chức, cá nhân trong việc thực hiện những nhiệm vụ đã được xác định trong chủ trương đầu tư dự án, quyết định phê duyệt của dự án để đảm bảo tiến độ thi công và chất lượng công trình; Thực hiện các nhiệm vụ khác liên quan đến triển khai các dự án.
Đối với Trưởng ban Chỉ đạo có nhiệm vụ ban hành Quy chế tổ chức, hoạt động của Ban Chỉ đạo và các cơ quan giúp việc; Điều hành, phân công nhiệm vụ cho các Thành viên Ban Chỉ đạo và các Tổ giúp việc của Ban Chỉ đạo; triệu tập, chủ trì các cuộc họp của Ban Chỉ đạo. Căn cứ nhu cầu, nhiệm vụ trong quá trình hoạt động, Trưởng ban quyết định việc thay đổi, bổ sung thành viên Ban Chỉ đạo.
Tại quyết định này cũng thành lập các Tổ giúp việc của Ban Chỉ đạo, gồm: Tổ Thường trực Ban Chỉ đạo; Tổ Chuyên gia; Tổ Phát triển nguồn nhân lực; Tổ Thể chế để tham mưu, nghiên cứu, tư vấn cho Ban Chỉ đạo về các nội dung liên quan đến việc triển khai các tuyến đường sắt kết nối Trung Quốc.
