Theo Sở Nội vụ, hướng dẫn này nhằm bảo đảm việc quản lý và tổ chức thực hiện các chương trình MTQG trên địa bàn tỉnh đúng quy định, hiệu quả và phù hợp với mô hình tổ chức chính quyền địa phương hai cấp trong khi chờ văn bản hướng dẫn cụ thể của Trung ương.
Căn cứ tình hình thực tế ở địa phương, trường hợp cần thiết, UBND cấp xã quyết định thành lập Ban Chỉ đạo xã để chỉ đạo thực hiện các chương trình MTQG giai đoạn 2021 - 2025. Cơ cấu, thành phần của Ban Chỉ đạo xã thực hiện tương tự như Ban Chỉ đạo tỉnh.
Việc thành lập Ban Quản lý Chương trình MTQG cấp xã hoặc phường do Phòng Kinh tế xã/Phòng Kinh tế, Hạ tầng và Đô thị phường chủ trì, phối hợp với các cơ quan liên quan xây dựng dự thảo quyết định, lập tờ trình UBND cấp xã xem xét, quyết định. Ban Quản lý có từ 11–13 thành viên, gồm: Chủ tịch UBND cấp xã làm Trưởng ban, Phó Chủ tịch UBND phụ trách lĩnh vực kinh tế làm Phó Trưởng ban, cùng các thành viên đại diện các tổ chức, đơn vị liên quan.
Ban Phát triển thôn, tổ dân phố do người dân bầu ra theo đúng quy chế, hương ước, quy ước đã thống nhất. Việc bầu cử các thành viên Ban Phát triển thôn phải được lập thành biên bản và gửi đến UBND cấp xã xem xét, quyết định. Thành phần từ 5 đến 7 thành viên, gồm: Trưởng thôn, hoặc Tổ trưởng dân phố làm Trưởng ban; các thành viên còn lại gồm: Bí thư Chi bộ khu dân cư, Trưởng Ban công tác mặt trận, đại diện các tổ chức chính trị - xã hội ở thôn và ít nhất 1 thành viên là người có uy tín, kinh nghiệm trong tổ chức thực hiện gói thầu có quy mô nhỏ, kỹ thuật đơn giản.
Theo ghi nhận tại một số địa phương, trong quá trình triển khai các chương trình MTQG theo mô hình chính quyền địa phương hai cấp, vẫn còn phát sinh một số khó khăn, vướng mắc trong công tác phân công, phối hợp giữa các đơn vị, đặc biệt ở các khâu giám sát, đánh giá, nghiệm thu và giải ngân dự án.
