Năm 2004, Trường Quân sự tỉnh được giao thêm một nhiệm vụ mới và đây cũng là một trong những nhiệm vụ trọng tâm, đó là đào tạo chỉ huy trưởng quân sự xã, phường, thị trấn (giai đoạn 2004 – 2010) theo Chỉ thị số 34/CT-BQP năm 2003 của Bộ Quốc phòng.
56 học viên khóa I được đào tạo trong thời gian 14 tháng đã tốt nghiệp ra trường với tỷ lệ khá, giỏi đạt trên 82% là sự khởi đầu tốt đẹp và nguồn động viên lớn để đội ngũ cán bộ, giáo viên nói riêng và nhà trường nói chung vượt lên những khó khăn, thiếu thốn về cơ sở vật chất, kinh nghiệm giảng dạy, năng động đổi mới hoàn thành khóa đào tạo thứ II cho 60 học viên thuộc các xã vùng sâu, vùng cao của tỉnh.
Phần lớn các học viên tốt nghiệp trở về địa phương đã và đang phát huy tốt vai trò tham mưu cho cấp ủy, chính quyền cơ sở trong việc thực hiện nhiệm vụ quân sự quốc phòng, đồng thời vận dụng sáng tạo những kiến thức được trang bị vào thực tế nhiệm vụ phát triển kinh tế – xã hội, công tác quân sự quốc phòng ở cơ sở. Một số đồng chí đã được bổ nhiệm giữ các chức vụ lãnh đạo chủ chốt trong cấp ủy Đảng, chính quyền địa phương. Đây còn là nguồn cán bộ kế cận triển vọng của nhiều xã, phường, nhất là các xã vùng sâu, vùng cao, vùng đặc biệt khó khăn.
Thượng tá Nguyễn Văn Ngọc - Chính ủy Trường Quân sự tỉnh Yên Bái cho rằng, thực hiện nhiệm vụ đào tạo mới theo Chỉ thị 34 của Bộ Quốc phòng thực sự là điều kiện và cơ hội tốt để nhà trường khẳng định vai trò và chức năng đào tạo của mình. Chính vì thế, quá trình tuyển sinh học viên được nhà trường xây dựng thành quy chế, thực hiện nghiêm ngặt từ khâu tuyển sinh đến quá trình đào tạo, bảo đảm các tiêu chuẩn quy định cũng như phù hợp với đặc điểm tình hình của địa phương. Công tác phối hợp hiệp đồng với các cơ quan của Bộ Chỉ huy Quân sự tỉnh và Trường Chính trị tỉnh được Ban Giám hiệu nhà trường, Khoa Giáo viên xây dựng kế hoạch giảng dạy chặt chẽ theo tháng và trong suốt khóa đào tạo, bảo đảm không để xảy ra hiện tượng bỏ sót nội dung, nhầm giờ hoặc chậm giờ. Cùng với đó, Trường chú trọng quan tâm gửi giáo viên đi đào tạo bồi dưỡng tại các trường quân đội, tổ chức tập huấn bồi dưỡng trước và trong suốt quá trình đào tạo. Đến nay, 100% giáo viên nhà trường đã được đào tạo cơ bản, trong đó 30% có trình độ đại học.
Hiện nay, Khoa Giáo viên, Trường Quân sự tỉnh đang đào tạo khóa thứ III chỉ huy trưởng quân sự xã, phường, thị trấn cho 70 học viên, thời gian đào tạo được nâng lên 17 tháng. Với hình thức đào tạo này, học viên tốt nghiệp được cấp cả bằng trung cấp quân sự và trung cấp lý luận chính trị – quản lý Nhà nước, rất thuận lợi cho việc tạo nguồn cán bộ chủ chốt ở cơ sở.
Thiếu tá Nguyễn Minh Tân, Trưởng khoa Giáo viên cho biết, ngoài tập trung huấn luyện cho học viên thì một trong những nhiệm vụ trọng tâm của Khoa tới đây là tổ chức cho giáo viên đi thực tế khu vực miền Tây và các xã vùng sâu, vùng cao, vùng đặc biệt khó khăn của tỉnh. Từ đó nắm bắt tình hình cụ thể công tác quân sự quốc phòng từng vùng, từng địa phương để có kiến thức thực tiễn sinh động, nâng cao chất lượng bài giảng.
Tâm huyết của đội ngũ cán bộ, giáo viên trong Khoa cũng là quyết tâm của Đảng ủy, Ban Giám hiệu Trường Quân sự tỉnh Yên Bái những mong đào tạo được một đội ngũ cán bộ quân sự cơ sở chất lượng, hiệu quả, tham gia xây dựng nền quân sự quốc phòng địa phương ngày một vững mạnh.
Minh Thúy