Khu Bảo tồn thiên nhiên Bát Xát có hơn 18,6 nghìn ha rừng, là nơi sinh sống của 976 loài thực vật bậc cao có mạch; nhóm thực vật nguy cấp, quý hiếm theo tiêu chuẩn Việt Nam và thế giới đã thống kê được 137 loài, trong đó nhóm loài họ Lan (Orchidaceae) chiếm ưu thế. Hệ thực vật cần bảo tồn với yếu tố đặc hữu đóng vai trò quan trọng nhất chiếm đến 10,8% tổng số loài ghi nhận được và cao hơn hệ thực vật của cả nước.
Việc làm giảm vật liệu cháy được thực hiện trên toàn bộ diện tích Khu Bảo tồn thiên nhiên Bát Xát được giao quản lý, trong đó tập trung vào vùng trọng điểm có nguy cơ cháy cao, khu vực chịu ảnh hưởng nặng của bão số 3 (Yagi) làm cây gãy đổ nhiều, thảm thực bì dày, khu vực giáp ranh với đất canh tác của người dân, chủ rừng khác, khu vực rừng tái sinh, tuyến tuần tra, kiểm tra rừng.
Từ tháng 4 đến tháng 5/2024, Ban quản lý Khu Bảo tồn thiên nhiên Bát Xát đã phối hợp với các trường học tổ chức cuộc thi Rung chuông vàng Tìm hiểu pháp luật về Lâm nghiệp năm 2024 cho học sinh tại 5 xã vùng cao: Y Tý, Dền Sáng, Sàng Ma Sáo, Trung Lèng Hồ, Nậm Pung.
Để nâng cao hiệu quả bảo vệ rừng và phòng, chống cháy rừng trong mùa hanh khô năm 2024, đặc biệt là trong dịp nghỉ Lễ 30/4 và 1/5/2024, Ban Quản lý Khu Bảo tồn thiên nhiên Bát Xát đã lập 13 chốt bảo vệ rừng, phòng chống cháy rừng tạm thời tại 5 xã vùng cao trên địa bàn huyện.
Ngay cả trong dịp tết, những người tuần rừng vẫn làm nhiệm vụ bảo vệ “kho vàng xanh” ở Khu Bảo tồn thiên nhiên Bát Xát.
Theo Luật Đa dạng sinh học quy định về khu bảo tồn có 4 cấp gồm: Vườn quốc gia, khu dự trữ thiên nhiên (khu bảo tồn thiên nhiên), khu bảo tồn loài - sinh cảnh, khu bảo vệ cảnh quan, trong đó vườn quốc gia là cấp độ cao nhất có nhiều cơ chế, phân bổ nguồn lực để bảo vệ nghiêm ngặt khỏi sự khai thác, can thiệp của con người.
