Do ảnh hưởng của vụ việc, các chuyến tàu SE22, TN4 và SE10 xuất phát từ ga Sài Gòn trong ngày 6/3 phải tạm dừng. Ngành đường sắt đang triển khai phương án chuyển tải hành khách bằng đường bộ qua ga Biên Hòa để tiếp tục hành trình.
Khoảng 14 giờ 50 phút cùng ngày, ngành đường sắt cũng xây dựng phương án tổ chức lại chạy tàu nhằm duy trì hoạt động vận chuyển. Theo đó, một đầu máy và toa xe của tàu SE22 được sử dụng lập tàu rỗng chạy từ ga Sài Gòn đến ga Dĩ An để đón hành khách của tàu SE7 từ ga Biên Hòa về ga Dĩ An, sau đó lập tàu SE7 chạy từ Dĩ An về lại ga Sài Gòn.
Trong khi đó, đoàn tàu SE7 đang nằm tại ga Biên Hòa được sử dụng để lập tàu SE4 chạy từ Biên Hòa đi Hà Nội.
Ngành đường sắt cũng tổ chức trung chuyển hành khách giữa hai ga Dĩ An – Biên Hòa đối với nhiều đoàn tàu khác. Cụ thể, hành khách tàu SE4 được chuyển từ Dĩ An đến Biên Hòa; hành khách tàu SPT1 và SE5 được chuyển từ Biên Hòa đến Dĩ An, sau đó sử dụng đoàn tàu SE4 tại Dĩ An để lập tàu SE5 chạy về Sài Gòn.
Đối với tàu SE2, hành khách được chuyển từ Dĩ An đến Biên Hòa, sau đó sử dụng đoàn tàu SE5 để lập tàu SE2 chạy từ Biên Hòa đi Hà Nội. Hành khách tàu SE11 được chuyển từ Biên Hòa đến Dĩ An, rồi sử dụng đoàn tàu SE2 để lập tàu SE11 chạy từ Dĩ An về Sài Gòn.
Ngoài ra, hành khách tàu SNT2 được chuyển từ Dĩ An đến Biên Hòa và sử dụng đoàn tàu SE11 để lập tàu SNT2 chạy từ Biên Hòa đi Nha Trang. Riêng đoàn tàu SPT1 được đình lưu tại ga Biên Hòa hoặc kéo gửi tại ga Hố Nai để chờ xử lý tiếp theo.
Ngành đường sắt cho biết đang tiếp tục theo dõi tình hình tại khu vực cầu Ghềnh và sẽ điều chỉnh kế hoạch vận hành tàu phù hợp nhằm bảo đảm an toàn, đồng thời hạn chế tối đa ảnh hưởng đến hành khách.
