Cuộc tấn công bằng tên lửa vào Israel và khả năng Israel sẽ đáp trả đã khiến Trung Đông rơi vào tình thế bấp bênh, với nhiều hãng hàng không hủy chuyến đến các sân bay trong khu vực. Hãng hàng không Emirates có trụ sở tại Dubai, Các Tiểu vương quốc Arab Thống nhất (UAE), cho biết hãng tạm dừng tất cả các chuyến bay đến và đi từ Iraq (Basra và Baghdad), Iran (Tehran) và Jordan (Amman) trong các ngày 4-5/10 do căng thẳng leo thang trong khu vực. Trong thông báo trên trang web, Emirates nhấn mạnh: "Hành khách quá cảnh qua Dubai để đến các điểm đến cuối cùng ở Iraq, Iran và Jordan sẽ không được chấp nhận ngay tại điểm xuất phát cho đến khi có thông báo mới".
Trong khi đó, hầu hết các chuyến bay quốc tế đến và đi từ Liban đều bị đình chỉ, mặc dù hãng hàng không quốc gia Middle East Airlines của Liban vẫn khai thác một số dịch vụ. Tối 3/10, một tòa nhà dân cư ở gần Sân bay Quốc tế Rafic-Hariri bị ném bom, vài phút sau khi chuyến bay của Middle East Airlines từ Dubai hạ cánh xuống sân bay. Hồi đầu tuần này, hãng Emirates thông báo sẽ hủy toàn bộ chuyến bay đến Beirut cho đến ngày 8/10. Hãng hàng không Etihad Airways của Abu Dhabi (UAE) đã nối lại dịch vụ đến Tel Aviv vào ngày 3/10, song hãng vẫn đình chỉ các chuyến bay đến và đi từ Beirut đến ngày 11/10.
Các chuyến bay của Air Arabia (UAE) đi từ Beirut đến Sharjah và Abu Dhabi vẫn bị đình chỉ, trong khi Egyptair (Ai Cập) thông báo sẽ tạm dừng các chuyến bay đến Beirut vô thời hạn. Hãng hàng không Royal Jordanian của Jordan cho hay các chuyến bay của hãng đến Beirut hiện không còn hoạt động do tình hình bất ổn. Iran Air và Iraq Airways đã đình chỉ các chuyến bay đến thủ đô Beirut của Liban cho đến khi có thông báo mới. Hãng hàng không Gulf Air của Bahrain và Qatar Airways (Qatar) cũng có động thái tương tự do lo ngại về tình hình an ninh. Middle East Airlines của Liban vẫn là hãng hàng không duy nhất vẫn vận hành một số chuyến bay từ Beirut, giữa lúc các quốc gia, trong đó có Anh, Pháp và Ireland, đang kêu gọi công dân rời khỏi Liban.
Trước đó ngày 30/9, Ủy ban châu Âu và Cơ quan An toàn Hàng không Liên minh châu Âu (EASA) đã ban hành bản tin về khu vực xung đột, đồng thời khuyến nghị các hãng hàng không tránh hoạt động trong không phận của Liban và Israel "ở mọi cấp độ bay".
